近日，我公司与中国科学院海洋研究所合作，利用Label free蛋白质组学平台进行了太平洋牡蛎蛋白质的分析，合作文章题目为A Label-Free Proteomic Analysis on Competent Larvae and Juveniles of the Pacific Oyster Crassostrea gigas，影响因子为3.234。

太平洋牡蛎具有一个典型的双相性的生命周期：深海的幼虫期和底栖的成熟期，之前的研究中都有对牡蛎变态的某些方面的研究，然而信息都是支离破碎的。此外，在基因组DNA或者mRNA水平、蛋白质水平的研究是缺乏的。蛋白质组研究被证明是动物变态过程中一个重要的研究方法。它被应用于许多海洋无脊椎动物，这些研究解释了变态过程中各种蛋白的功能，提供了全面的潜在的分子机制的信息，对于牡蛎变态的研究，蛋白质组学的研究可以补充和扩大当前的知识。

在该研究中，研究者们使用了label free的蛋白组学的方法，比较和研究太平洋目的的幼体（CL）和稚贝（JU）总共鉴定了788个蛋白：其中392是CL的蛋白质，636个蛋白来之JU。每个样本的蛋白质组的GO分析显示在两个阶段都有活跃的代谢过程，进一步定量分析显示在这两个样本之间有117个差异蛋白表达。这些蛋白质分成8组：细胞骨架、细胞粘附、蛋白质合成和讲解、免疫和逆境反应、特定组织的生长、信号调节、代谢和能源供应、运输和其他蛋白。研究者们又使用实时荧光定量PCR进行验证试验证实：30个检查基因中有20个mRNA和蛋白质水平表现出相同的趋势。 差异表达的蛋白可能在以下过程中扮演者角色：在变态期和之后的时期的组织重建、信号转导、器官发育。有一些差异表达的蛋白扮演着异常的角色，如胰凝乳蛋白酶。这项研究工作的结果为研究者提供了一个太平洋牡蛎在蛋白水平变态和变态后的概述。差异表达蛋白的功能的未来研究将有助于获得对双壳类变态更加深入的了解。